למרות שמדובר בטיפול בטוח, לא מומלץ לבצע חוקן באופן קבוע אלא רק על פי המלצת רופא. שימוש לא נכון בחוקנים עלול להוביל לנזק של רקמת המעיים והרקטום או זיהום.